More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2147 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  100 
 
 		 220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1094  ribonuclease HII  59.65 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  62.75 
 
 		 230 aa  234  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2882  Ribonuclease H  52.43 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.507441 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  57.14 
 
 		 207 aa  214  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  57.21 
 
 		 197 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  57.22 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  52.02 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  53.61 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 256 aa  174  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  51.56 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  51.31 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.69 
 
 		 277 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  44.81 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 257 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  51.22 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  53.16 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  56.19 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  50.74 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  53.16 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  53.16 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  47.89 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  51.5 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.78 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  52.88 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  48.69 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.76 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.92 
 
 		 308 aa  161  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  46.57 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  48.78 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  50.53 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 201 aa  159  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 259 aa  158  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  45.67 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  49.3 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.08 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  40.81 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1176  Ribonuclease H  50.79 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1460  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  50.26 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  49.5 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  52.58 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  52.58 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.94 
 
 		 198 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  45.27 
 
 		 199 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  44.61 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.31 
 
 		 214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  51.87 
 
 		 260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  43.43 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  47.64 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  52.08 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  44.68 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  47.92 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  46.91 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  50.51 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  44.55 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  51.61 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  46.63 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  44.79 
 
 		 193 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>