More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0920 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  68.77 
 
 		 253 aa  359  3e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  65.74 
 
 		 258 aa  316  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  48.58 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.41 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  49.4 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  50.98 
 
 		 257 aa  241  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  52.94 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  50.99 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  49.8 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  50.59 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  50.99 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  49.41 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.59 
 
 		 259 aa  225  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  50.59 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  49.11 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  55.85 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  51.33 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  52.02 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  48.88 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  44.54 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  43.4 
 
 		 338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  44.54 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.78 
 
 		 216 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  43.08 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 219 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  46.38 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 211 aa  188  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  48.74 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 202 aa  185  7e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  47.52 
 
 		 232 aa  185  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 202 aa  185  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  46.57 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  45.45 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  47.96 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  49.25 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  47.46 
 
 		 209 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  48.48 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  40 
 
 		 308 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  49.26 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  44.93 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  48.79 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 208 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  42.58 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.79 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  46.6 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 207 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  47.45 
 
 		 208 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  42.57 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  37.35 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 208 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 201 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  46.77 
 
 		 204 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  45.21 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 201 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  48.11 
 
 		 199 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 212 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 207 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 212 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  47.25 
 
 		 198 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  44.15 
 
 		 197 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  48.47 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  48.47 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 207 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  47.54 
 
 		 227 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>