More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0777 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  100 
 
 		 256 aa  534  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  49.8 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  48.41 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  48.58 
 
 		 255 aa  242  6e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  44.14 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  46.22 
 
 		 257 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  45.02 
 
 		 257 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  46.09 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  46.22 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  46.61 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  46.22 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  46.22 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  46.22 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  46.22 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  46.22 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  45.82 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  45.42 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  46.69 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  48.2 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  41.41 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  49.74 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  40.62 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  44.83 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  44.83 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 338 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  39.84 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  50.28 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  46.8 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  46.57 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 216 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  40.4 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  44.9 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  39.92 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46.15 
 
 		 214 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  41.33 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.63 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  47.28 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  37.86 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  37.86 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  47.98 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  36.51 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  46.39 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  44.78 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  45.81 
 
 		 197 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  46 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  47.64 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  44.9 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  40.87 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  47.06 
 
 		 201 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 206 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  40.15 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 198 aa  158  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 207 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 198 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 209 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  43.81 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  47 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  43.2 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 201 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  45.79 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  44.95 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  43.5 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  44.68 
 
 		 198 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  44 
 
 		 207 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  45.31 
 
 		 227 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 207 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>