More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0936 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  68.98 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  68.98 
 
 		 229 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  66.51 
 
 		 216 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  61.86 
 
 		 220 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  61.86 
 
 		 220 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  61.4 
 
 		 220 aa  235  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  58.67 
 
 		 210 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  58.99 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  56.5 
 
 		 208 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 222 aa  206  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  52.04 
 
 		 199 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  55.56 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  52.53 
 
 		 210 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  53.03 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  49.77 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  52.82 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 212 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 212 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1266  ribonuclease HII  55.72 
 
 		 249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  50.25 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  51.74 
 
 		 269 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  55 
 
 		 235 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  54.14 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  51.24 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 203 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  54.19 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  54.44 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  52.02 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  55 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.92 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 214 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 217 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 207 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  50 
 
 		 250 aa  168  9e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  53.57 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  53.89 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  50 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  53.89 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  51.67 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  50 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  48.77 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  50 
 
 		 214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  50 
 
 		 201 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  50 
 
 		 214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  50 
 
 		 214 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 248 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.92 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 207 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 207 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  48.98 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  46.39 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.99 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50 
 
 		 208 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.48 
 
 		 213 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1208  ribonuclease HII  52.31 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.621532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 213 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 248 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1081  ribonuclease HII  52.82 
 
 		 284 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 216 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  48.96 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1226  ribonuclease HII  52.31 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  52.15 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  47.57 
 
 		 208 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  54.14 
 
 		 214 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  54.14 
 
 		 214 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  54.14 
 
 		 214 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.19 
 
 		 198 aa  158  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  54.14 
 
 		 214 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  54.14 
 
 		 214 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  41.6 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.27 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  53.59 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  48.59 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  49.49 
 
 		 202 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  53.59 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  50 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 217 aa  155  7e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 198 aa  155  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>