More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0879 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  54.79 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  53.59 
 
 		 221 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  50 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  54.7 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  54.7 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  51.87 
 
 		 200 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  54.05 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  40.43 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2028  ribonuclease HII  55.14 
 
 		 199 aa  165  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  48.33 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  56.04 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  52.2 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  42.7 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  51.38 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  50.56 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50.78 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  48.9 
 
 		 191 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.7 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  44.32 
 
 		 197 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  50.28 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  45.74 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46.23 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  50 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.27 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  42.35 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  50 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  42.25 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.65 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.74 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  46.94 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  47.69 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 195 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  38.92 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  47.59 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  45.6 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 257 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.52 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.52 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  40.61 
 
 		 277 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 268 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.28 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  46.37 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  50 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  46.53 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  44.21 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  43.62 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  45.81 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  44.89 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  44.26 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>