More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16251 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  61.08 
 
 		 195 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  61.08 
 
 		 195 aa  227  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  59.14 
 
 		 200 aa  217  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  59.26 
 
 		 199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2028  ribonuclease HII  57.81 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  53.55 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1594  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  46.96 
 
 		 221 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  46.56 
 
 		 277 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  45 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 272 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  48.62 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 227 aa  148  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  46.41 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  44.2 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  43.09 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  42.55 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 256 aa  144  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  44.2 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  46.39 
 
 		 199 aa  141  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  41.97 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  40.11 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  39.34 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 257 aa  138  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  42.78 
 
 		 191 aa  137  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  40.31 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  43.09 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  42.93 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  42.47 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 279 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  44.26 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.41 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  42.39 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  41.08 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1353  Ribonuclease H  41.53 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  42.39 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  39.5 
 
 		 215 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  46.41 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  46.41 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  41.99 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  40 
 
 		 209 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  41.99 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 256 aa  132  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  44.81 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  43.65 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  44.09 
 
 		 255 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  44.09 
 
 		 255 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  41.44 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  41.85 
 
 		 255 aa  131  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  41.76 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  40.33 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.7 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  40.62 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  40.62 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  40.33 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  46.67 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  38.38 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  41.88 
 
 		 269 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  41.44 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>