More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_16931 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  100 
 
 		 205 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  89.27 
 
 		 205 aa  337  5e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1594  ribonuclease HII  86.83 
 
 		 205 aa  327  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  74.15 
 
 		 209 aa  304  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 196 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2028  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  49.16 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  44.09 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  44.44 
 
 		 221 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 211 aa  141  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  43.33 
 
 		 255 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  42.78 
 
 		 277 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  39.69 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  43.85 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  41.49 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  40 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  41.58 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  41.49 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  40.32 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  44.69 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 256 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  41.54 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  44.15 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  44.69 
 
 		 253 aa  131  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  43.55 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 260 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  42.47 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  41.08 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 253 aa  127  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  37.82 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  39.34 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  40.86 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  38.58 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  45 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  42.31 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  41.9 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  39.34 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  41.53 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 255 aa  124  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 255 aa  124  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  41.27 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  40.64 
 
 		 257 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  41.53 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  43.58 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  40.66 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  41.27 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  44.69 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  39.69 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  39.78 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  40 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  40 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  44.02 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  44.02 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  41.53 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  41.92 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  39.56 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  40.56 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  37.84 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  41.8 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  35.21 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  38.3 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  40.66 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  38.8 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  37.37 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 224 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 254 aa  121  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  41.99 
 
 		 256 aa  121  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>