More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1594 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1594  ribonuclease HII  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  88.78 
 
 		 205 aa  338  5e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  86.83 
 
 		 205 aa  326  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  74.63 
 
 		 209 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 195 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2028  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  41.09 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  44.44 
 
 		 221 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  45 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  42.22 
 
 		 277 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  41.54 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  43.33 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 255 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  38.34 
 
 		 215 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  42.62 
 
 		 207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  42.31 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 181 aa  132  5e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  42.08 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  39.06 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  41.85 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  43.09 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  41.44 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  42.39 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  41.44 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  40.66 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  41.53 
 
 		 272 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  40 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  41.76 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  39.89 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 260 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  37.37 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 272 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 198 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  41.9 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  42.7 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 257 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  36.32 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  39.34 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  39.34 
 
 		 240 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  41.21 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2443  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0013683  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  40.72 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  40 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  40.72 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 240 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  40 
 
 		 213 aa  124  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  40 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  40.86 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  40.56 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  42.46 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  38.25 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  45.25 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  41.15 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  42.25 
 
 		 245 aa  123  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  37.7 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  44.57 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  44.57 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  38.31 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  39.57 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  39.36 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  41.67 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  38.62 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  38.1 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  39.2 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  40.84 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  41.34 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  37.56 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  38.17 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>