More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1273 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  47.74 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  48.74 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 257 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  43.41 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.7 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  46.19 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  43.5 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  40.5 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  43.22 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  43 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  42 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  39.05 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  45.96 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  44.16 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  44.66 
 
 		 216 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  47.18 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  41.97 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  42.19 
 
 		 197 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 257 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  45 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  45 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  41.29 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  38.5 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 203 aa  141  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  41.23 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  44 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  45.85 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  41.41 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  39.7 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  41.95 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  40 
 
 		 255 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  41.97 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  42.86 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  42.21 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  41.38 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  43.62 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  44.28 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  41.43 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  43.98 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  40 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  43.46 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  41.85 
 
 		 254 aa  134  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  41.38 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  39.3 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  41.87 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  41.38 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  42.33 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  41.87 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  40.5 
 
 		 308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  43.39 
 
 		 198 aa  131  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  41.95 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  38.27 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  42.33 
 
 		 196 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  41.31 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  43.63 
 
 		 206 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  43.5 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  44.81 
 
 		 197 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>