More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1019 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  100 
 
 
209 aa  429  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  48.79 
 
 
253 aa  197  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  48.06 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.72 
 
 
257 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  48.21 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  48.21 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  45.33 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  43.78 
 
 
338 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  43.15 
 
 
283 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  45.9 
 
 
256 aa  167  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  46.39 
 
 
253 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  43.15 
 
 
283 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  42.64 
 
 
283 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  41.54 
 
 
277 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  48.29 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  42.93 
 
 
210 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  43.35 
 
 
229 aa  161  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  46.03 
 
 
256 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  40.87 
 
 
256 aa  160  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  46.15 
 
 
259 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  45.92 
 
 
258 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  41.75 
 
 
255 aa  157  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  44.9 
 
 
260 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.08 
 
 
268 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  47.72 
 
 
257 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  44 
 
 
254 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  47.72 
 
 
257 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  47.72 
 
 
257 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  47.72 
 
 
257 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  42.29 
 
 
217 aa  155  6e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  45.21 
 
 
242 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  44.51 
 
 
198 aa  154  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  47.21 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  47.21 
 
 
257 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  47.21 
 
 
257 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  48.3 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  42.35 
 
 
255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  45.11 
 
 
198 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  42.78 
 
 
209 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  46.7 
 
 
257 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  43.52 
 
 
254 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  43 
 
 
208 aa  150  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  40.89 
 
 
232 aa  149  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  40.1 
 
 
204 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  43.55 
 
 
202 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  40 
 
 
206 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  42.71 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  41.79 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  40.54 
 
 
211 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  45.51 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  42.93 
 
 
196 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  42.62 
 
 
202 aa  144  9e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  42.62 
 
 
202 aa  144  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  42.5 
 
 
214 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  40.82 
 
 
211 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  41.12 
 
 
212 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  42.41 
 
 
191 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  40.82 
 
 
211 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  42.35 
 
 
198 aa  143  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  40.11 
 
 
198 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  41.76 
 
 
197 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  41.53 
 
 
206 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  41.88 
 
 
191 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  44.38 
 
 
203 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  41.63 
 
 
210 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  38.5 
 
 
219 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  40.96 
 
 
219 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  42.86 
 
 
201 aa  141  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  40.39 
 
 
212 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  40.54 
 
 
202 aa  141  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  39.78 
 
 
197 aa  141  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  40.39 
 
 
212 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  43.16 
 
 
216 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  41.85 
 
 
215 aa  141  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  36.55 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  42.13 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  38.3 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  41.44 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  42.31 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  42.61 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  40.39 
 
 
199 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  40.66 
 
 
211 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  41.57 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  37.77 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  41.3 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  41.58 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  35.18 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  41.3 
 
 
235 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  40.44 
 
 
226 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  41.05 
 
 
255 aa  138  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  39.78 
 
 
204 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  40.76 
 
 
240 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  41.44 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  42.25 
 
 
218 aa  137  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  39.78 
 
 
221 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  40.84 
 
 
230 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0701  ribonuclease HII  41.71 
 
 
195 aa  137  1e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  41.44 
 
 
217 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  41.53 
 
 
205 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  41.41 
 
 
269 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>