More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl537 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  54.5 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 253 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 242 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 338 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  44.5 
 
 		 277 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.15 
 
 		 268 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  42.7 
 
 		 250 aa  159  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  44.1 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  44 
 
 		 257 aa  157  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  44 
 
 		 257 aa  157  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  45.2 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 283 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  40 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  40 
 
 		 283 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  40.86 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  39.89 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  41.08 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  43.62 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  43 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  41.33 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  42.47 
 
 		 205 aa  147  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  42.47 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  39.36 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  41.94 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  39.46 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  42.19 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  41.4 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  43.75 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  42.7 
 
 		 253 aa  141  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  40.86 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  40.7 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  40.7 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 190 aa  140  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  44 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  41.53 
 
 		 202 aa  141  9e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 260 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  41.53 
 
 		 202 aa  141  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  41.62 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  37.06 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 257 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  43.5 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  45.2 
 
 		 254 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  41.99 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  38.59 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  37.31 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  44 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  44.28 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  36.65 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  44.28 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  37.06 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  43 
 
 		 257 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  36.89 
 
 		 256 aa  138  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  41.94 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  38.83 
 
 		 197 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  39.57 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  39.57 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  37.63 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  39.47 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  36.71 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  39.57 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  42.39 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  40.96 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  43.89 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  38.24 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  40.84 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  41.36 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2303  ribonuclease HII  47.73 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000380421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  38.5 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  37.5 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  38.74 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  42.08 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 214 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>