More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0189 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  51.58 
 
 		 256 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 255 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 253 aa  167  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 255 aa  161  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  45.55 
 
 		 277 aa  157  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1045  Ribonuclease H  44.86 
 
 		 213 aa  157  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.42 
 
 		 308 aa  157  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  45.2 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 242 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 250 aa  153  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  44.09 
 
 		 253 aa  151  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  42.63 
 
 		 212 aa  150  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  44.21 
 
 		 257 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  39.68 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  41.49 
 
 		 338 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 227 aa  148  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  41.36 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  42.25 
 
 		 268 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 260 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  40.84 
 
 		 198 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  42.19 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 212 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  42.35 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  39.04 
 
 		 283 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  41.84 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  41.8 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.16 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 254 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  41.48 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  38.83 
 
 		 283 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  38.83 
 
 		 283 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  41.67 
 
 		 255 aa  141  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  39.78 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  43.02 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  39.89 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  41.24 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  38.74 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  40.93 
 
 		 224 aa  137  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  36.79 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  41.53 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  36.23 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  39.15 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  40.32 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  38.1 
 
 		 307 aa  136  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  39.46 
 
 		 226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  38.19 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 207 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  39.89 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 260 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  46.45 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  35.83 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  43.58 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  35.9 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  39.36 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  39.68 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  38.1 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 259 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  40.21 
 
 		 230 aa  130  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  39.46 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  44.74 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  43.68 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  42.53 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  38.55 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  40.45 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  44.21 
 
 		 257 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  37.99 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  37.17 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  44.21 
 
 		 257 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  40 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  39.34 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>