More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0414 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  67.96 
 
 		 216 aa  251  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  57.62 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  47.03 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  51.26 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.29 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.38 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  52.31 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  50.74 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.59 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.59 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  48.5 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50.77 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50.77 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.94 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  48.26 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  44.95 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  48.78 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 191 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.22 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  46.53 
 
 		 191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  46.57 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.34 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  48.29 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  44.93 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  47.6 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  48.72 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  46.67 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  40.57 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  40.87 
 
 		 256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  47.21 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  48.72 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  48.72 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  48.72 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.86 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  44.13 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0799  RNase HII  51.46 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  47.69 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  43.54 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  48.78 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.49 
 
 		 240 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.76 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  48.06 
 
 		 338 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.24 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.76 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  47.29 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  41.83 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  46.5 
 
 		 248 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 283 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 283 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  40.82 
 
 		 198 aa  148  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  47.47 
 
 		 197 aa  148  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.31 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  46.97 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  43.9 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  46.5 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 283 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1176  Ribonuclease H  47.98 
 
 		 196 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  39.5 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  43.69 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  44.89 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1460  ribonuclease HII  47.98 
 
 		 196 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  40.51 
 
 		 256 aa  145  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  47.42 
 
 		 198 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  49.52 
 
 		 260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  42.45 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  46.67 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  47 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  42.19 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>