More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1623 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  60.8 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  57.62 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  43.4 
 
 		 211 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  42.92 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  50.49 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  42.65 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 256 aa  157  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  41.33 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  41.75 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  49 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  48.98 
 
 		 338 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  49.24 
 
 		 283 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  46.5 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  46.35 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  48.73 
 
 		 283 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  43.62 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  50 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  41.24 
 
 		 257 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  39.18 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  39.9 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  46.45 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  40.8 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  34.56 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  48.63 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  44.83 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  48.28 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  38.66 
 
 		 277 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  46.31 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  45.1 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  43.02 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  45.86 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  44.28 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  48.5 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  47.34 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 211 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 191 aa  141  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  37.44 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 240 aa  141  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  45.69 
 
 		 207 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  44.21 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  43.16 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.88 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  45.25 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  47.52 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  45.96 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 209 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  45.79 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  43.39 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  48.35 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  45.25 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  36.22 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  44.69 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  44.13 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  45.45 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  37.37 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  43.81 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  39.7 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  45.11 
 
 		 201 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  44.69 
 
 		 207 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 292 aa  134  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  41.3 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>