More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1282 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  71.83 
 
 		 221 aa  310  9e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  61.78 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  61.73 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  61.38 
 
 		 205 aa  217  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  61.38 
 
 		 205 aa  217  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  53.85 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  50.26 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  51.63 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 195 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  53.48 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  44.04 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.09 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  51.34 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  51.27 
 
 		 260 aa  167  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  51.35 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  43.96 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  49.45 
 
 		 196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  48.66 
 
 		 195 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  51.3 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  50.52 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.73 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.22 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  44.04 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 206 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.4 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  47.8 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  46.43 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  47.09 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 218 aa  158  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  46.35 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  46.56 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  46.56 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  44.83 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  47.15 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  46.84 
 
 		 202 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  46.56 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  47.89 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  44.83 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  43.72 
 
 		 199 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 203 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  44.15 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  43.06 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  45.05 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  44.78 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  47.57 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  43.16 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  46.32 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  48.39 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  40.7 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  48.76 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  45.26 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  40.7 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  45.37 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>