More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3847 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  100 
 
 		 208 aa  434  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  74.35 
 
 		 191 aa  301  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  61.58 
 
 		 203 aa  243  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  55 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  59.69 
 
 		 194 aa  228  4e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0851  Ribonuclease H  58.97 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  54.87 
 
 		 198 aa  221  8e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  54.12 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  56.91 
 
 		 202 aa  214  9e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  55.31 
 
 		 196 aa  201  8e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  46.92 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  51.58 
 
 		 206 aa  186  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  50 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  50 
 
 		 283 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 283 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 283 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  44.81 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  51.4 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 256 aa  168  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 338 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  46.6 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  47.51 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  49.72 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  45 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  45.05 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 268 aa  160  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.72 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 299 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  44.27 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  47.49 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.43 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50.56 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 204 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  46.52 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  45.08 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  43.75 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  46.84 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  50 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  44.26 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  48.9 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 209 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  45.56 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  43.16 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.19 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  50.57 
 
 		 267 aa  154  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  48.57 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  45 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  45.56 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  46.86 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  45 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  43.92 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  45 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  46.52 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  44.89 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>