More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0851 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0851  Ribonuclease H  100 
 
 		 220 aa  457  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  63.64 
 
 		 203 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  58.97 
 
 		 208 aa  243  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  61.98 
 
 		 191 aa  240  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  60.62 
 
 		 198 aa  238  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  56.84 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  55.34 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  51.9 
 
 		 221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  54.04 
 
 		 202 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  54.87 
 
 		 194 aa  208  5e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  49.73 
 
 		 196 aa  181  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.19 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  46.77 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.04 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  50 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  47.87 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  47.73 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  48.3 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  50 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45 
 
 		 268 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  46.89 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  42.35 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  44.2 
 
 		 338 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  45.73 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  48.3 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  45.79 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  48.3 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  49.43 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  49.47 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.73 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  47.16 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  46.33 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  44.04 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  45.86 
 
 		 308 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  46.59 
 
 		 235 aa  147  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.33 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  46.07 
 
 		 199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 199 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  43.32 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  45.81 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  42.7 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  45.81 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  45.3 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  46.59 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  47.43 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  46.02 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  46.89 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  44.63 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 299 aa  142  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  45 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  47.46 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  44.89 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.09 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2303  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 195 aa  141  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000380421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  44.69 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  43.18 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  46.33 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  45.2 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  46.93 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  43.62 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  43.75 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  47.16 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  47.46 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  42.86 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  48.86 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  43.58 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  43.18 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>