More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0404 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  100 
 
 		 203 aa  423  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  61.58 
 
 		 208 aa  243  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  60.82 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0851  Ribonuclease H  63.64 
 
 		 220 aa  241  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  60.11 
 
 		 191 aa  238  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  58.08 
 
 		 198 aa  234  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  59.79 
 
 		 201 aa  229  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  57.58 
 
 		 202 aa  228  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  57.89 
 
 		 194 aa  216  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  55.74 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  49.31 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  50 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.95 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.72 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  50 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  49.43 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  47.06 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  48.86 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  42.41 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  42.71 
 
 		 198 aa  154  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 198 aa  154  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 198 aa  154  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  49.43 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  42.21 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  42.21 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  42.21 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 217 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  50 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  47.78 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.73 
 
 		 268 aa  151  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.07 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  42.23 
 
 		 283 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.33 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  47.03 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  47.98 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.02 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  41.26 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  40.48 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 256 aa  148  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 213 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.33 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 240 aa  147  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 211 aa  147  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 230 aa  147  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  47.16 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  43.01 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  48 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  45 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2443  ribonuclease HII  46.89 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0013683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  46.33 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  43.17 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  43.17 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 338 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  45.26 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  44.21 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  43.17 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  45.13 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  46.89 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  43.35 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  44.09 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  46.07 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  44.75 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  42.61 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  44.9 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 299 aa  142  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  44.38 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>