More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1103 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  100 
 
 
198 aa  409  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  56.78 
 
 
209 aa  225  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0946  ribonuclease HII  56.5 
 
 
209 aa  202  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  54.64 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  51.02 
 
 
199 aa  193  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  48.28 
 
 
229 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  50 
 
 
202 aa  188  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  52.15 
 
 
209 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  52.15 
 
 
209 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  50 
 
 
248 aa  184  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  50.5 
 
 
212 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  49.46 
 
 
248 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  50.5 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  46.57 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  49.73 
 
 
209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  46.73 
 
 
269 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  49.5 
 
 
208 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50.82 
 
 
202 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50.82 
 
 
202 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  48.39 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  50 
 
 
198 aa  178  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  47.29 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0701  ribonuclease HII  53.16 
 
 
195 aa  177  5.999999999999999e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  46.23 
 
 
199 aa  177  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  48.37 
 
 
211 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  47.89 
 
 
210 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46.5 
 
 
214 aa  177  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  50.55 
 
 
268 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  49 
 
 
212 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  49.46 
 
 
249 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  46.7 
 
 
204 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.92 
 
 
240 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  50.53 
 
 
232 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  49.5 
 
 
218 aa  175  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  50 
 
 
232 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  49.47 
 
 
236 aa  174  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  50.81 
 
 
218 aa  174  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  48.65 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  47.59 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  48.44 
 
 
242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  45.64 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.17 
 
 
198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.49 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  48.04 
 
 
206 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.64 
 
 
217 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  48.11 
 
 
198 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  48.11 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.64 
 
 
217 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  48.97 
 
 
257 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.66 
 
 
198 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.81 
 
 
197 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.66 
 
 
198 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  45.64 
 
 
214 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  45.64 
 
 
214 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  45.64 
 
 
214 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  47.85 
 
 
203 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.33 
 
 
277 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.17 
 
 
198 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  43.72 
 
 
206 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  47.18 
 
 
208 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  48.96 
 
 
206 aa  168  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  50 
 
 
257 aa  168  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  47.18 
 
 
213 aa  168  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  48.13 
 
 
198 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  48.4 
 
 
197 aa  167  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  47.57 
 
 
198 aa  167  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.89 
 
 
204 aa  167  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  50.27 
 
 
245 aa  167  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  47.03 
 
 
198 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  47.03 
 
 
198 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  47.03 
 
 
198 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.57 
 
 
198 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.57 
 
 
198 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.57 
 
 
198 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.95 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  48.19 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.49 
 
 
198 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  48.24 
 
 
210 aa  165  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  49.19 
 
 
197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.03 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  48.33 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.03 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  45.11 
 
 
211 aa  164  8e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  50.8 
 
 
238 aa  164  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  50.8 
 
 
238 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  46.49 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45.88 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  48.37 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  46.49 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  47.03 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  48.11 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  48.11 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  44.67 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  47.03 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  46.49 
 
 
198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  48.11 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  48.11 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  46.23 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  44.62 
 
 
292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  47.03 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>