More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0314 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2028  ribonuclease HII  74.87 
 
 		 199 aa  264  8e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  70.16 
 
 		 200 aa  246  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  59.26 
 
 		 196 aa  234  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  60 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  60 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  53.01 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  54.05 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1594  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  52.49 
 
 		 229 aa  160  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  49.72 
 
 		 221 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  53.01 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  47.51 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  43.85 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50.55 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  50.54 
 
 		 204 aa  147  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  50 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  41.76 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  41.53 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  42.55 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  46.63 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 256 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  43.17 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  46.96 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  43.58 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 230 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  47.57 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  47.28 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  50.8 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  45 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  46.46 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  42.47 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  53.3 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  41.99 
 
 		 196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  47.15 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 257 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  43.33 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  46.96 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  46.96 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 250 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46.49 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  42.62 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  41.45 
 
 		 254 aa  134  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  46.63 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  38.83 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  44.68 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  44.28 
 
 		 198 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  43.39 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  44.28 
 
 		 198 aa  131  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 267 aa  131  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 253 aa  131  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  45.26 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  40.85 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  44.04 
 
 		 206 aa  130  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>