More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0398 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  99.55 
 
 
220 aa  436  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  88.53 
 
 
220 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  64.65 
 
 
258 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  60.93 
 
 
222 aa  255  3e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  61.86 
 
 
279 aa  251  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  61.21 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  59.81 
 
 
229 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  56.65 
 
 
210 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  62.15 
 
 
216 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  54.55 
 
 
208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  54.77 
 
 
199 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  50.25 
 
 
210 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  50.26 
 
 
257 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  49.74 
 
 
257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  55.25 
 
 
240 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  55.25 
 
 
209 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  55.25 
 
 
209 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  55.25 
 
 
235 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.67 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  50.76 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  50.77 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  50.5 
 
 
213 aa  171  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  44.27 
 
 
206 aa  171  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  51.27 
 
 
292 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  47.76 
 
 
214 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  53.54 
 
 
206 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  48.26 
 
 
214 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  48.26 
 
 
214 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  48.26 
 
 
214 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  49.76 
 
 
269 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.5 
 
 
214 aa  168  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  49.75 
 
 
212 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  46.86 
 
 
210 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  49.75 
 
 
212 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.85 
 
 
230 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  46.38 
 
 
217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  46.38 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.3 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  51.76 
 
 
267 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.8 
 
 
202 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.8 
 
 
202 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  51.37 
 
 
211 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  51.26 
 
 
258 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  49.18 
 
 
248 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  46.84 
 
 
256 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  47.96 
 
 
253 aa  159  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  50.83 
 
 
209 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  47.85 
 
 
201 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  43.94 
 
 
307 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  45.79 
 
 
218 aa  158  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.39 
 
 
201 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  47.15 
 
 
283 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  48.66 
 
 
207 aa  158  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.83 
 
 
208 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.54 
 
 
248 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  51.27 
 
 
266 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  49.22 
 
 
257 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44.62 
 
 
256 aa  156  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  49.2 
 
 
208 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  45.65 
 
 
199 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  46.19 
 
 
199 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  48.7 
 
 
257 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  47.28 
 
 
198 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  45.31 
 
 
203 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  48.7 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  46.11 
 
 
283 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  45.64 
 
 
250 aa  155  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  44.66 
 
 
208 aa  154  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  48.7 
 
 
257 aa  154  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.53 
 
 
268 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  45.36 
 
 
217 aa  154  9e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.92 
 
 
202 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  47.31 
 
 
207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  48.7 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  48.7 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  48.7 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  47.06 
 
 
201 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  48.7 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50.28 
 
 
240 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  46.77 
 
 
207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  46.38 
 
 
216 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  47.31 
 
 
207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  49.18 
 
 
249 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.52 
 
 
211 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  47.31 
 
 
207 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  40.09 
 
 
232 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  50.25 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  46.11 
 
 
283 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  45.63 
 
 
207 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  43.59 
 
 
308 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  46.86 
 
 
236 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  46.24 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  45.45 
 
 
198 aa  151  8.999999999999999e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  43.81 
 
 
204 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  46.15 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  46.15 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1266  ribonuclease HII  52.53 
 
 
249 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  43.78 
 
 
254 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  45.5 
 
 
218 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>