More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2476 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  73.39 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  52.89 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  50.23 
 
 		 303 aa  191  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  55 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  52.51 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  50.22 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  50.9 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  47.37 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  43.32 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  42.18 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  51.87 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  45.09 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  40.72 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  39.72 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  40.55 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  34.29 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  40.45 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  46.04 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  37.5 
 
 		 203 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  37.61 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1844  ribonuclease HII  39.55 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  41.94 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  41.21 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  39.25 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  39.73 
 
 		 253 aa  128  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  34.74 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  41.55 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  33.96 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  38.11 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  34.76 
 
 		 277 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  33.8 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  35.15 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  39.7 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  36.97 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  38.21 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  41.41 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  40.7 
 
 		 201 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  37.07 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  33.96 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  40.49 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  39.07 
 
 		 229 aa  121  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  38.07 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  35.94 
 
 		 279 aa  121  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  37.09 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  37.69 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  38.38 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  38.78 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  36.87 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  37.38 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  37.62 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  36.95 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  35.29 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  34.76 
 
 		 257 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  36.87 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  34.4 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  33.94 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  35.81 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  35.92 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  36.5 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  35.65 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  37.62 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  38.69 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  38.69 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  41.43 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  35.38 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  36.5 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  36 
 
 		 254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  36.79 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  38.69 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  34.88 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  36.5 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  36.5 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  38.57 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  38.6 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  30.53 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  33.64 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  38.19 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  32.35 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  37.19 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  36.15 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1405  Ribonuclease H  41.71 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000142088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  41.04 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  35.91 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  37.09 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  35.07 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  35.35 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  38.99 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  37.19 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  36.28 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  34.67 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  33.94 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  40 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  37.19 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>