More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1519 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  100 
 
 		 224 aa  453  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  62.98 
 
 		 240 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  59.9 
 
 		 228 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  64.22 
 
 		 270 aa  242  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  64.49 
 
 		 269 aa  240  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  57.73 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  57.67 
 
 		 241 aa  235  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  55.14 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  61.76 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  57.14 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  60.71 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  57.62 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  57 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  57 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  57 
 
 		 239 aa  207  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  55.05 
 
 		 264 aa  207  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  55.66 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  56.86 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  55.56 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  58.25 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  54.11 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  51.72 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  48.26 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  50 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.08 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  44.57 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.33 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  41.12 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  44.5 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 257 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  42.19 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  42.39 
 
 		 191 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  35.18 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 206 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  45.79 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  45.25 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  41.85 
 
 		 191 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  41.5 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  42.7 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  43.3 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  45.26 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 242 aa  141  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  40.93 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 198 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 198 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  43.52 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 198 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 272 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  42.5 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  42.64 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  38.78 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  45.95 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  36.84 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 198 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 272 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  44.75 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  43.82 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 257 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 213 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>