More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1312 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  100 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  92.94 
 
 		 269 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  59.34 
 
 		 240 aa  261  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  66.18 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  66.67 
 
 		 232 aa  251  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  63.05 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  69.46 
 
 		 211 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  64.29 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  62.98 
 
 		 228 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  57.98 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  56.33 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  58.88 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  58.94 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  58.45 
 
 		 239 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  58.45 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  58.45 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  55.65 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  57.97 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  59.91 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  57 
 
 		 228 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  63.05 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  54.81 
 
 		 228 aa  195  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  39.59 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 216 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  48.7 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  48.7 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.94 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 199 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  46.88 
 
 		 204 aa  158  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50 
 
 		 209 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50 
 
 		 209 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 208 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  39.68 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  42.29 
 
 		 203 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 209 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  40 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  42.49 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  45.7 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  37.69 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  45.83 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  41.87 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  47.67 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  46.6 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 216 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 218 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  39.59 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  45.41 
 
 		 202 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 214 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 210 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 191 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  45.51 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  43.92 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 191 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  44.2 
 
 		 248 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 198 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 198 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  42.44 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  43.26 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  42.44 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  43.26 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  42.44 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  38.6 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 209 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 201 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 201 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 208 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  37.31 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 211 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  44.6 
 
 		 215 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>