More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5919 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  100 
 
 		 258 aa  503  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  67.73 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  54.95 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  59.33 
 
 		 228 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  58.94 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  60 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  58.96 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  56.31 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  57.42 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  58.94 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  58.94 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  58.94 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  58.94 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  57.62 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  59.91 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  57.49 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  57.82 
 
 		 232 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  57.75 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  51.12 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  62.5 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  63 
 
 		 211 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  58.45 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 249 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  44.6 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  44.6 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  44.6 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 240 aa  158  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 214 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  47.57 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  45.59 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.02 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1252  Ribonuclease H  51.1 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.787291  normal  0.579547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  41.75 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  41.15 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 199 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  36.22 
 
 		 206 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 208 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  40.31 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  47.24 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  39.11 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  40.84 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  41.12 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  43.84 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  38.55 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 232 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  44.16 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  45.79 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  39.79 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  39.38 
 
 		 216 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  33.01 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  44.16 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  42.63 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  37.91 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  44.21 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  42.78 
 
 		 198 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  45.08 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  39.67 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  41.97 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  41.45 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  41.45 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  40.93 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  40.95 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  39.89 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  39.77 
 
 		 203 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  42.64 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 216 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>