More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1154 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  100 
 
 		 240 aa  470  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  75.32 
 
 		 240 aa  304  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  63.27 
 
 		 307 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  63.29 
 
 		 241 aa  242  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  60.98 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  57.77 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  63.37 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  58.94 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  56.33 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  59.13 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  58.82 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  58.82 
 
 		 239 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  58.82 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  58.96 
 
 		 228 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  58.02 
 
 		 264 aa  215  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  55.14 
 
 		 224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  59.19 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  57.84 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  57 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  58.42 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  58.16 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  59.3 
 
 		 275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  38.35 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 218 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  45.08 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  45.59 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  46.83 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  45.27 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  44.2 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  45.51 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  48.19 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 216 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  41.75 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  41.05 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  40.82 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  44.16 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 202 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 202 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  46.63 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  42.42 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  44.2 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  42.54 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  38.78 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 214 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  43.88 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  43.87 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  45 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46.49 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  41.24 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  44.57 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  42.35 
 
 		 230 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 198 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  40.21 
 
 		 216 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1966  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.413568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  40.19 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  46.46 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  41.67 
 
 		 308 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  39.23 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  43.78 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 198 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  38.27 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  42.08 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  42.08 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  42.08 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  42.39 
 
 		 191 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  42.08 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 198 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>