More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3253 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  65.67 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  59.34 
 
 		 270 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  61.69 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  63.29 
 
 		 269 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  62.62 
 
 		 224 aa  234  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  57.77 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  61.95 
 
 		 232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  57.14 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  61.76 
 
 		 211 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  57.89 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  60.49 
 
 		 240 aa  214  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  56.59 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  53.54 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  54.5 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  56.31 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  55.5 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  54.55 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  53.59 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  53.59 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  53.11 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  54.9 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  45.36 
 
 		 210 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45.31 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  50 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  38 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 198 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 198 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  45.81 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  41.75 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  46.6 
 
 		 338 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 268 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  45.23 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  42.64 
 
 		 211 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  41.01 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  44.85 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  39.5 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 207 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  44.28 
 
 		 229 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 211 aa  148  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 209 aa  148  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 209 aa  148  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  40 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  43.4 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  45.59 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  42.25 
 
 		 193 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  40.21 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  46.52 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  43.33 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 199 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  45.85 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  42.2 
 
 		 229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  45.85 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  44.95 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  43.15 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  40.72 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  37.76 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  45.65 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 199 aa  141  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  45.3 
 
 		 198 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  37.76 
 
 		 272 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>