More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2189 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  70.92 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  69.46 
 
 		 270 aa  244  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  61.73 
 
 		 257 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  61.58 
 
 		 228 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  61.76 
 
 		 240 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  66.33 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  59.3 
 
 		 307 aa  222  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  59.11 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  60.71 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  58.16 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  64.1 
 
 		 258 aa  207  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  58.42 
 
 		 241 aa  207  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  55.77 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  55.77 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  55.77 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  55.24 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  55.61 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  56.63 
 
 		 249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  54.9 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  59.18 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  56.77 
 
 		 275 aa  184  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.39 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  43.28 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  40.21 
 
 		 256 aa  165  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  43.14 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 248 aa  161  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  40.8 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.47 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  40.84 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  40.84 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 255 aa  158  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  48.66 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  48.66 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  44.78 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  36.98 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  44.12 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  37.69 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  39.09 
 
 		 277 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.81 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  40.8 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  44.09 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  40.8 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  44.57 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  37.37 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  38.54 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  40.2 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 198 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 260 aa  147  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1252  Ribonuclease H  46.28 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.787291  normal  0.579547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  40.78 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  45.11 
 
 		 197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  45.11 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  44.04 
 
 		 338 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  44.39 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  45.08 
 
 		 229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  46.83 
 
 		 267 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 199 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  43 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 234 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>