More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2092 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  66.98 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  66.98 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  66.98 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  66.51 
 
 		 249 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  66.05 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  66.98 
 
 		 264 aa  269  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  64.45 
 
 		 228 aa  261  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  59.19 
 
 		 240 aa  224  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  58.65 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  55 
 
 		 307 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  54.5 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  60.29 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  59.8 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  57.35 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  54.5 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  56.19 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  54.81 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  54.9 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  54.33 
 
 		 269 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  53.2 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  51.72 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  51.96 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45.62 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  46.6 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  46.15 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  37.38 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  45.86 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  44.97 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  43.63 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  42.33 
 
 		 283 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 217 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  41.47 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  45.77 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  39.15 
 
 		 308 aa  148  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  44.24 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  42.71 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  43.69 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  37.68 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  45.51 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  45.51 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  45.51 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 283 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  44.85 
 
 		 202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  43.98 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  44.38 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  42.46 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  41.67 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  44.81 
 
 		 207 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  41.27 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  41.27 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  43.35 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  45.51 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  45.51 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  45.51 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  45.51 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  42.46 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  45.51 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  43.26 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  40.7 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  42.23 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 219 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  42.31 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  37.44 
 
 		 206 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  43.35 
 
 		 267 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  40.4 
 
 		 257 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  44.26 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  44.26 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  48.09 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  43.08 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>