More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3417 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  100 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  67.5 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  67.61 
 
 		 269 aa  257  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  66.67 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  65.57 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  64.57 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  63.37 
 
 		 240 aa  244  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  61 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  61.24 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  66.33 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  61.76 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  58.64 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  64.85 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  58.41 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  57.01 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  57.48 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  57.48 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  57.48 
 
 		 239 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  57.62 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  55.98 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  56.19 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  58.54 
 
 		 275 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  54.95 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  53.55 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  53.55 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 211 aa  175  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  51.32 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  48.7 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  51.02 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  39.09 
 
 		 206 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 218 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  49.02 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  51.63 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  51.23 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 209 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  41.33 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  43.75 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.96 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 214 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 214 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.73 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 279 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1252  Ribonuclease H  51.65 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.787291  normal  0.579547 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  37.68 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 206 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 202 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 202 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  45.24 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  39.69 
 
 		 198 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  44.02 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.42 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  39.8 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  42.22 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  43.68 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  48.09 
 
 		 198 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  52.69 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 198 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 198 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  45.83 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  39.8 
 
 		 272 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  45.31 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>