More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2098 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2098  ribonuclease H  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0455436  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  45.66 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  38.39 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  40 
 
 		 206 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  40.27 
 
 		 199 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  41.04 
 
 		 219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  40.44 
 
 		 211 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  41.1 
 
 		 197 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  37.14 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  39.32 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  40.89 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  41.98 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  38.17 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  36.49 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  39.27 
 
 		 216 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  39.44 
 
 		 230 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  40 
 
 		 202 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  39.56 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  38.31 
 
 		 210 aa  135  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  39.09 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  38.27 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  35.06 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  36.99 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  34.65 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  39.17 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  39.91 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  38.14 
 
 		 217 aa  130  3e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  40.76 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  39.81 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  40 
 
 		 212 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  39.15 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  38.43 
 
 		 215 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  39.15 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  38.72 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  40 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  41.01 
 
 		 198 aa  128  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  40.28 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  39.38 
 
 		 217 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  38.77 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  40.57 
 
 		 197 aa  126  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  38.72 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  38.99 
 
 		 204 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  38.36 
 
 		 209 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  39.62 
 
 		 198 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 191 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  38.86 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  38.03 
 
 		 199 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  36.75 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  39.42 
 
 		 191 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  40.28 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  38.77 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  39.46 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  36.49 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  39.17 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  39.81 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  36.77 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  37.84 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  38.03 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  35.78 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  36.25 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  38.39 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 201 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  40 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  36.94 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  38.05 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  38.5 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  39.81 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  41.67 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  39.53 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  38.94 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  39.53 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  38.5 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  39.29 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  36.25 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  39.91 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  41.36 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  40.55 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 230 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  39.27 
 
 		 224 aa  118  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  35.98 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  39.07 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  40.19 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  38.84 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  40.64 
 
 		 212 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0701  ribonuclease HII  39.09 
 
 		 195 aa  118  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  38.99 
 
 		 208 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  38.25 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  40.09 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  36.32 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  37.75 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  40.93 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  37.9 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  39.81 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>