154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05114 on replicon BN001305
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  100 
 
 
339 aa  702    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  47.81 
 
 
347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  43.46 
 
 
260 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  37.83 
 
 
393 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  31.4 
 
 
239 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  30.89 
 
 
239 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  31.9 
 
 
239 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  27.37 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  31.49 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  31.31 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  30.47 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  29.17 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  33.33 
 
 
208 aa  72.4  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  31.47 
 
 
209 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  29.79 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  30.49 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  31.33 
 
 
195 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  29.58 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  30.7 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  30.21 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  27.59 
 
 
212 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  27.2 
 
 
234 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  33.05 
 
 
198 aa  62.8  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  30.04 
 
 
212 aa  62.8  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  31.42 
 
 
207 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  32.94 
 
 
230 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  28.51 
 
 
211 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  28.07 
 
 
218 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  29.96 
 
 
198 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1839  ribonuclease HII  30.29 
 
 
196 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010294  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  29.82 
 
 
205 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  29.12 
 
 
245 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  29 
 
 
277 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  27.47 
 
 
201 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  26.43 
 
 
221 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  29.94 
 
 
262 aa  53.1  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  25.31 
 
 
234 aa  52.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  29.89 
 
 
249 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  30.12 
 
 
208 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  26.72 
 
 
201 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  28.9 
 
 
198 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  29.53 
 
 
228 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  30.86 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  32.75 
 
 
208 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  27.84 
 
 
221 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  27.54 
 
 
207 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  30.59 
 
 
216 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  30.3 
 
 
235 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  29.76 
 
 
216 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  28.43 
 
 
218 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  28.72 
 
 
214 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  28.72 
 
 
214 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  28.77 
 
 
207 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  26.47 
 
 
236 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  28.72 
 
 
214 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  30.06 
 
 
215 aa  49.3  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  28.17 
 
 
207 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  27.33 
 
 
256 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  25.65 
 
 
208 aa  49.3  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  30.68 
 
 
198 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  28.64 
 
 
191 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  27.49 
 
 
199 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  25.73 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  27.38 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  28.79 
 
 
209 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  28.1 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  28.64 
 
 
191 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  29.32 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  25.43 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  31.25 
 
 
199 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  31.61 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  32.28 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  27.08 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  28.33 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  31.61 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  31.21 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  26.27 
 
 
240 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  29.07 
 
 
203 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  28.87 
 
 
210 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  27 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  29.53 
 
 
210 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1460  ribonuclease HII  25.3 
 
 
196 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1176  Ribonuclease H  25.3 
 
 
196 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  27.67 
 
 
202 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  26.61 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  31.03 
 
 
240 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  26.16 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  26.92 
 
 
198 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  26.73 
 
 
213 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  26.92 
 
 
198 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  28.79 
 
 
254 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  26.92 
 
 
198 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  25.24 
 
 
201 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  26.87 
 
 
198 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  26.87 
 
 
198 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  28.86 
 
 
198 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  26.87 
 
 
198 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  28.36 
 
 
198 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  25.73 
 
 
217 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  27.06 
 
 
218 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>