More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1393 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  45.15 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  43.66 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  44.61 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  40.89 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  43.27 
 
 		 239 aa  160  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  38.05 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  42.31 
 
 		 239 aa  158  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  41.83 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  37.38 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  39.5 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  39.56 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  42.44 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  36.27 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  37.88 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  40.82 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  40.21 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  38.83 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  33.02 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  31.67 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  32.2 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  32.34 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  34.73 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  38.99 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  29.07 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  32.85 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  29.22 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  28.57 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  33.54 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  33.66 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  28.77 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  30.59 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  30.66 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  33.18 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1353  Ribonuclease H  33.71 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  33.13 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  32.55 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  31.28 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  29.63 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  28.91 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  30.95 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  36.52 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  35 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  36.77 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  36.77 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  31.65 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  32.87 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  30.52 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  28.63 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  31.71 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  28.5 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  30.88 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  26.6 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  30.99 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  35.8 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  32.95 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  28.14 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  30.27 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  30.33 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  31.72 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  30.05 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  32.92 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  29.38 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  29.38 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  30.52 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  30.66 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  30.52 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  30.05 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  33.52 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  36.88 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  30.1 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  31.52 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  28.31 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  34.73 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  33.93 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  30.1 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  30.1 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  31.28 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  30.1 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  29.61 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  25.79 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  27.88 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  28.64 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  29.58 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  28.99 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  30.67 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  31.03 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  28.64 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  31.48 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  33.54 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  36.81 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  30.1 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  31.33 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  29.49 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>