More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1729 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  51.26 
 
 
198 aa  191  9e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  48.48 
 
 
195 aa  170  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  45.92 
 
 
198 aa  167  7e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  44.27 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  43.9 
 
 
212 aa  159  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  47.85 
 
 
213 aa  159  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  44.28 
 
 
213 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  39.81 
 
 
239 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  40.28 
 
 
239 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  40.28 
 
 
239 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  39.15 
 
 
244 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  41.23 
 
 
224 aa  142  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  37.23 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  39.41 
 
 
205 aa  134  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  43.56 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  40.39 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  37.75 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  36.36 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  36.95 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  38.46 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  41.21 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  37.56 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  35.1 
 
 
234 aa  105  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  35.56 
 
 
234 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  36.36 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  32.08 
 
 
228 aa  94  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  33.65 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  34.86 
 
 
260 aa  86.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  28.44 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  29.65 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  36.23 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  34.63 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  34.15 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  34.15 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  32.04 
 
 
246 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  31.71 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  34.65 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  31.88 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  30.29 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  33.68 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  29.35 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  30.81 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  32.84 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  31.98 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  33.17 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  35.8 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  31.43 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  31.34 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  30.95 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  33.17 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  35 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  32.78 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  36.14 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  33.99 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  31.63 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  34.03 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  36.75 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  29.77 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  32.35 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  32.35 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  29.77 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  30.3 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  35.29 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  31.68 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  34.92 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  33.7 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  35.29 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  32 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  36.41 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  30.37 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  30.88 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  31.71 
 
 
277 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  31.75 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  32.98 
 
 
248 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  31.68 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  34.97 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  26.5 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  32.67 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  31.43 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  30.17 
 
 
339 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  31.78 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  34.38 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  32.71 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  33.9 
 
 
197 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  31.22 
 
 
189 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  31.74 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  32.71 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  32.71 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  34.76 
 
 
214 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  34.76 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  34.76 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  31.13 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  33.17 
 
 
255 aa  61.6  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  34.57 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  31.34 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  33.69 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  31.03 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  30.77 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  33.01 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>