188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31007 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  100 
 
 		 347 aa  717    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  47.41 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  42.91 
 
 		 260 aa  192  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  35.49 
 
 		 393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  34.58 
 
 		 239 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  34.17 
 
 		 239 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  33.74 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 239 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  32.76 
 
 		 213 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  32.6 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  31.2 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  31.74 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  31.56 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  31.66 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  30.56 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  30.6 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  31.47 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  30.25 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  30.95 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  29.65 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  31.25 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  32.13 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  28.63 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  30.13 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  30.45 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  29.91 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  32.16 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  30.6 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  28.21 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  28.63 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  30.73 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  30.21 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  29.59 
 
 		 249 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  27.4 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  31.55 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  33.9 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  30.73 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  29.66 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  27.07 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  31.07 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  27 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  31.79 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  30.51 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  30.69 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  28.27 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  31.47 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1505  ribonuclease H  29.19 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  32.2 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  32.2 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  29.17 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  31.07 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  31.67 
 
 		 208 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  29.21 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  30.99 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  29.15 
 
 		 201 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  24.88 
 
 		 183 aa  53.1  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0912  ribonuclease HII  27.03 
 
 		 287 aa  53.1  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  26.04 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  26.04 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  29.21 
 
 		 199 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  30.17 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  28.43 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  30.17 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  30.17 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  31.28 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  31.28 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  30.81 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  28.4 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  27.37 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  27.56 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  29.29 
 
 		 217 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  28.07 
 
 		 193 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  29.15 
 
 		 208 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  26.2 
 
 		 202 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  30.68 
 
 		 210 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  29.65 
 
 		 214 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  26.94 
 
 		 207 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  26.2 
 
 		 202 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  25.11 
 
 		 207 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  42.19 
 
 		 197 aa  49.7  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  28.86 
 
 		 236 aa  49.7  0.00007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  27.54 
 
 		 207 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  25.11 
 
 		 207 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  24.48 
 
 		 208 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  26.9 
 
 		 218 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  31.03 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  28.43 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  48.08 
 
 		 199 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  29.56 
 
 		 197 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  32.14 
 
 		 197 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  27.46 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  28.5 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1839  ribonuclease HII  27.78 
 
 		 196 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  28.5 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  26.01 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  34.62 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  28.5 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  27.8 
 
 		 198 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  27.23 
 
 		 198 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>