More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1216 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  55.19 
 
 		 213 aa  228  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  50.93 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  49.29 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  48.83 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  39.81 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  42.59 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  40.18 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  44.61 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  40.18 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  39.19 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  38.03 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  38.32 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  37.75 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  37.07 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  35.29 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  37.56 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  37.13 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  38.58 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  37.62 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  36.16 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  30.34 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  33.97 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  35.47 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  32.31 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  34.1 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  35.58 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  30.13 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  29.86 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  33.13 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  31.72 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  31.86 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  33.94 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  33.96 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  30.19 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  30.3 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  30.43 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  33.54 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  34.1 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  32.82 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  32.04 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  32.04 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  30.23 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  32.04 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  32.91 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  30.92 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  30.92 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  32.32 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  33.12 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  30.43 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  33.12 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  30.92 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  34.59 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  30.92 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  35.84 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  30.92 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  32.35 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  30.92 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  32.35 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  30.51 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  34.3 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  30.43 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  30.62 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  29.03 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  33.94 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  33.94 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  30.64 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  33.16 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  34.81 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  31.25 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  29.81 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  31.1 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  30.43 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  28.83 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  28.57 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  32.08 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  32.92 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  31.45 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  34.29 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  31.96 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  31.92 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  31.1 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  34.13 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  30.48 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  31.89 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  29.81 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  29.47 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  34.1 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  32.54 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  32.91 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  32.3 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>