More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0193 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  58.25 
 
 		 208 aa  244  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  37.88 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  39.32 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  40.8 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  43.56 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  36.45 
 
 		 224 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  37.73 
 
 		 277 aa  124  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  38.83 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  37.07 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  35.32 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  39.22 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  38.58 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  35.53 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  34.67 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  37.25 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  34.15 
 
 		 234 aa  98.6  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  35.33 
 
 		 197 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  35.22 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  29.89 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  34.54 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  33.69 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  30 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  36.08 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  36.08 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  34.02 
 
 		 248 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  34.59 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  34.34 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  33.73 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  34.34 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  32.83 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  33 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  30.65 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  33.73 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  30.61 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2888  ribonuclease HII  37.13 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0614829  normal  0.459177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  32.42 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  32 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  33.73 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  31.48 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  34.59 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  33.53 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  37.13 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  32.23 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  34.73 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  33.15 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  28.34 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  38.06 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  33.93 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  29.15 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  29.41 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  30.1 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  30.1 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  30.1 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  37.13 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  30.93 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  32.43 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  29.41 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1459  ribonuclease HII  36.53 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0235521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  34.32 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  32.46 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  30.96 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  31.93 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  33.13 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1464  ribonuclease HII  36.53 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0142588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  33.13 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  34.65 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  32.46 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  29.06 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  29.3 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  31.66 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  32.14 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  31.31 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  32.92 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  32.08 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  36.53 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  29.38 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  36.53 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  32.42 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  32.34 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>