More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI02520 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  42.91 
 
 
347 aa  192  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  43.78 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  37.87 
 
 
393 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  36.36 
 
 
239 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  37.61 
 
 
239 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  37.17 
 
 
239 aa  118  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  34.16 
 
 
244 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  36.11 
 
 
213 aa  106  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  35.15 
 
 
277 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  36.16 
 
 
212 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  35.32 
 
 
212 aa  95.5  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  33.48 
 
 
219 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  33.49 
 
 
213 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  34.86 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  32.23 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  33.65 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  32.08 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  33.95 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  30.37 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  30.59 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  32.73 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  31.65 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  29.65 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  30.77 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  30.99 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  34.11 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  31.28 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  36.31 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  31.02 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  32.95 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  33.33 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  29.76 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  35.71 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  29.41 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  29.27 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  29.49 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  31.96 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  35.71 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  35.71 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  35.71 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  35.71 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  35.71 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  34.1 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  34.76 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  28.45 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  31.77 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  26.7 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  34.15 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  32.93 
 
 
217 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  33.74 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  30.97 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  32.93 
 
 
217 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  31.28 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  33.13 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  33.54 
 
 
218 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  33.33 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6711  predicted protein  27.64 
 
 
189 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00445618  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  32.32 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  32.32 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  32.32 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  34.55 
 
 
208 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  32.54 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  32.54 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  29.73 
 
 
197 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  28.38 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  31.76 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  29.17 
 
 
198 aa  59.3  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  33.13 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  26.15 
 
 
216 aa  59.3  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  32.18 
 
 
236 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  30.18 
 
 
230 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  32.02 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  32.02 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  30.14 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  30.14 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  29.29 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  33.14 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  32.16 
 
 
292 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  26.09 
 
 
197 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  29.76 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  29.2 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  30.04 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  30.26 
 
 
198 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  28.88 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  30.26 
 
 
198 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  30.06 
 
 
338 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  29.9 
 
 
197 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  30.72 
 
 
198 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  27.9 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  31.74 
 
 
211 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  31.29 
 
 
214 aa  56.2  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  30.6 
 
 
206 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  27.06 
 
 
229 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  30.41 
 
 
184 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  30.26 
 
 
208 aa  55.5  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  30.89 
 
 
213 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  30 
 
 
208 aa  55.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  30.59 
 
 
242 aa  55.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  32.72 
 
 
240 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>