More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1305 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  73.94 
 
 		 198 aa  287  7e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  68.23 
 
 		 198 aa  275  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  65.43 
 
 		 207 aa  268  4e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  48.48 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  39.5 
 
 		 205 aa  140  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  40.38 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  42.5 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 213 aa  131  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 219 aa  131  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  37.98 
 
 		 239 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  39.61 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  37.98 
 
 		 239 aa  121  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  36.84 
 
 		 244 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  34.96 
 
 		 277 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  37.25 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 211 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  36.32 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  35.62 
 
 		 228 aa  85.1  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  37.78 
 
 		 234 aa  85.1  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 210 aa  84.3  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  32.41 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  32.31 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  36.23 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  35.27 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  33.84 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  34.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  33.82 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  34.87 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  34.11 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  30 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  30 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  34.78 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  33.67 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  34.34 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  32.5 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  31.53 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  34.39 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  32.84 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  31.53 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  33.54 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  32.02 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  29.33 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  32.02 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  32 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  31.79 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  31.98 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  32.77 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  36.42 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  29.65 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  32.47 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  32.16 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  32.66 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  32.66 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  32.82 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  29.35 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  32.18 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3267  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  31.98 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  30.39 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  34.48 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  33.75 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  32.47 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  34.71 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  32.83 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  33.16 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  32.2 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  32.66 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  33.71 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  33.9 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  31.12 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  32.32 
 
 		 250 aa  64.7  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  31.41 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  31.41 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  31.41 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  32.8 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  31.55 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  31.52 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  33.66 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  31.79 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>