More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1943 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  54.88 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  55.19 
 
 		 212 aa  228  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  54.33 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  50.94 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  49.77 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  42.01 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  41.1 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  44.61 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  44.34 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  39.73 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  43.2 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  38.77 
 
 		 277 aa  154  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  44.28 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  37.44 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  42.52 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  41.43 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  39.73 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  43.13 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  40 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  40.52 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  39.32 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  43.59 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  37.39 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  35.32 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  32.76 
 
 		 347 aa  88.2  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  33.49 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  35.78 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  35.08 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  35.05 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  36.71 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  34.31 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  34.93 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  34.31 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  34.98 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  33.65 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  36 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  36.88 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  34.29 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  33.66 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  33.01 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  34.6 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  36.55 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  32.53 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  33.65 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  34.31 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  31.71 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  30.26 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  32.24 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  35.38 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  34.91 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  30.95 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  35.64 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  33.97 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  34.41 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  32.81 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  36.48 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  33.5 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  33.85 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  33.5 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  34.13 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  34.13 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  34.45 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  32.67 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  31.78 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  32.08 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  34.86 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  34.13 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  32.28 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  35.8 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  32.28 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  33.18 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  35.8 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  33.97 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  32.86 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  32.63 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  32.86 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  31.71 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  33.98 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  33.16 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  32.06 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  32.66 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  34 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  32.86 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  31.01 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  33.16 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  33.51 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  30.62 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  32.98 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  33.16 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>