More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0985 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  100 
 
 
234 aa  461  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  63.03 
 
 
210 aa  246  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  56.89 
 
 
228 aa  215  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  58.26 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  47.19 
 
 
234 aa  174  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  45.97 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  40.65 
 
 
212 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  43.66 
 
 
205 aa  147  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  43.96 
 
 
211 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  39.19 
 
 
212 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  40.38 
 
 
224 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  40 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  37.67 
 
 
239 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  36.64 
 
 
239 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  36.11 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  34.48 
 
 
277 aa  133  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  35.35 
 
 
239 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  39.23 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  43.58 
 
 
219 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  38.65 
 
 
213 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  35.1 
 
 
209 aa  105  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  40.49 
 
 
198 aa  102  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  32.2 
 
 
205 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  34.15 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  37.07 
 
 
198 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  33.17 
 
 
208 aa  89  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  36.32 
 
 
195 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  30 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  37.79 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  33.33 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  34.03 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  34.16 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  34.16 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  36.59 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  34.16 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  33.66 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  33.82 
 
 
253 aa  72  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  32.35 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  33.5 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  34.92 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  36.07 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  32.06 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  34.92 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  32.05 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  32.2 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  37.35 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  36.02 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  34.21 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  33.5 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  33.5 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  33.49 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  29.91 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  28.88 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  33.17 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  37.95 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  37.95 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  37.84 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  34.59 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  36.36 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  31.45 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  34.38 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  38.14 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  35.19 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  34.1 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  31.31 
 
 
208 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  33.33 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  36.25 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  34.91 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  35.5 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  35 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  35.5 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  32.37 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  31.4 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  35.29 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1505  ribonuclease H  30.4 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  28.5 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  28.5 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  31.31 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  34.08 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  34.1 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  33.33 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  30.64 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  34.3 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  37.1 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  36.56 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  36.56 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  36.56 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  36.56 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  36.56 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  36.56 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  31.98 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  36.56 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  30.1 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  30.3 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  31.28 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3267  ribonuclease HII  32.35 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  28.37 
 
 
207 aa  63.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  30.06 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  28.18 
 
 
198 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>