More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1966 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  49.79 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  51.48 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  53.42 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  41.63 
 
 		 212 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  34.6 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  31.8 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  31.8 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  31.54 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  38.7 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  37.39 
 
 		 213 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  32.22 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  32.64 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  35.29 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  36.52 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  30.74 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  36.28 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  35.17 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  35.56 
 
 		 209 aa  98.6  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  34.38 
 
 		 198 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  35.79 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  37.78 
 
 		 195 aa  85.1  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  34.96 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  29.07 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  29.06 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  34.56 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  35.39 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  30.25 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  29.65 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  35.08 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  28.51 
 
 		 393 aa  75.5  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  34.83 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  32.3 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  29.74 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  29.96 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  32.81 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  28.09 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  34.03 
 
 		 201 aa  72  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 206 aa  72  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  34.25 
 
 		 198 aa  72  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  32.72 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  32.16 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  30.77 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  32.8 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  33.51 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  34.71 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  33.19 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  32.29 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  30.77 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  28.89 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  32.46 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  35.39 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  32.98 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  31.96 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  30.11 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  30.11 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  31.63 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  31.08 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  29.05 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  31.47 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  31.08 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  28.89 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  30.85 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  33.64 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  31.61 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  33.64 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  28.83 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  31.38 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  30.57 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  31.37 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  29.02 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  30.91 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  33.02 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  31.84 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  31.58 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  25.7 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  29.69 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  31.58 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  31.58 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  33.02 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  31.58 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  26.69 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  31.58 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  31.58 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  31.58 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  31.58 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  35.96 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  26.87 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  29.02 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  29.82 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  29.8 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  35.11 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  31.67 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>