More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0684 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  100 
 
 
244 aa  486  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  71.66 
 
 
239 aa  340  1e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  72.13 
 
 
239 aa  339  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  70.49 
 
 
239 aa  338  4e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  54.51 
 
 
277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  46.76 
 
 
212 aa  174  9e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  40.95 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  39.81 
 
 
212 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  35.29 
 
 
219 aa  155  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  36.74 
 
 
212 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  37.44 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  40.44 
 
 
224 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  35.61 
 
 
205 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  38.6 
 
 
213 aa  144  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  39.15 
 
 
209 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  34.4 
 
 
210 aa  141  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  39.9 
 
 
205 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  35.38 
 
 
211 aa  137  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  36.11 
 
 
234 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  32.33 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  38.42 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  34.36 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  32.22 
 
 
234 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  36.95 
 
 
198 aa  121  8e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  38.01 
 
 
208 aa  118  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  36.84 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  35.27 
 
 
198 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  37.1 
 
 
207 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  34.16 
 
 
260 aa  108  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  33.74 
 
 
347 aa  95.1  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  30.54 
 
 
393 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  30.21 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  34.13 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  29.86 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  29.65 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  31.03 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  33.93 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  33.94 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  26.19 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  31.58 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  34.1 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  32.96 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  30.77 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  30.77 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  33.33 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  29.07 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  35.93 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  30.19 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  32.53 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  27.6 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  29.41 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  30.29 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  32.78 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  30.41 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  26.74 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  29.89 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  31.19 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  29.17 
 
 
207 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  30.81 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  27.03 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  27.03 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  28.49 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  31.31 
 
 
191 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  27.36 
 
 
218 aa  62.4  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  28.4 
 
 
183 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  31.31 
 
 
191 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  27.91 
 
 
229 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  28.98 
 
 
184 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  27.59 
 
 
198 aa  62  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  32.74 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  31.18 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  32.14 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  30.86 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  29.24 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  26.53 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  27.89 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  27.75 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  28.64 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  28.4 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  28.64 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  29.21 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  27.83 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  24.65 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  31.07 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  28.4 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  25.98 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  28.4 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  31.21 
 
 
189 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  29.23 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  30.37 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  28.4 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  29.78 
 
 
207 aa  59.7  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  26.77 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  28.78 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  29.23 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  31.28 
 
 
198 aa  58.9  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  29.8 
 
 
266 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  27.72 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  31.43 
 
 
182 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  27.19 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>