More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0991 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  60.62 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  54.42 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  52.04 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  53.68 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  54.24 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  50.23 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  48.02 
 
 		 244 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 231 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  53.77 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  53.21 
 
 		 252 aa  162  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  46.48 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  47.44 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  45.54 
 
 		 222 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  41.89 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  31.14 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  40 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  45.87 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  36.45 
 
 		 242 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  39.05 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  34.75 
 
 		 308 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  41.06 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  37.61 
 
 		 206 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  41 
 
 		 253 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  38.35 
 
 		 206 aa  123  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  39.56 
 
 		 227 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  34.23 
 
 		 256 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  35.51 
 
 		 221 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  38.1 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  40.09 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  38.25 
 
 		 210 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  36.45 
 
 		 207 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  38.35 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  40.39 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 225 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  38.54 
 
 		 204 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  39.32 
 
 		 213 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  38.76 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  40.87 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  37.8 
 
 		 201 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  38.57 
 
 		 212 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  38.57 
 
 		 212 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  38.76 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  38.76 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  40.09 
 
 		 210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  38.76 
 
 		 198 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 224 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  35.12 
 
 		 245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  38.83 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  37.02 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  37.07 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  36.67 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  36.59 
 
 		 211 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  39.81 
 
 		 198 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  39.51 
 
 		 198 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  39.42 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  38.03 
 
 		 201 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  39.71 
 
 		 201 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  38.42 
 
 		 191 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  37.33 
 
 		 209 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  38.12 
 
 		 207 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  38.1 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  36.71 
 
 		 198 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  35.78 
 
 		 219 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  36.45 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  38.24 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  40.95 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  38.61 
 
 		 203 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  36.84 
 
 		 205 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  35.16 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  37.62 
 
 		 202 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  37.26 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  37.5 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  36.04 
 
 		 217 aa  109  5e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  36.36 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  33.71 
 
 		 254 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  40.39 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  38.99 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  31.65 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  37.07 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  37.68 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  34.38 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  37.68 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  36.89 
 
 		 196 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  37.68 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  35.92 
 
 		 199 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  36.91 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  32.48 
 
 		 256 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>