More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09220 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  100 
 
 
250 aa  475  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  48.53 
 
 
221 aa  158  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  49.07 
 
 
262 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  50 
 
 
272 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  49.36 
 
 
246 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  46.79 
 
 
303 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  45.81 
 
 
260 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  50.97 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  45 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  48.13 
 
 
279 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  50.24 
 
 
273 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  43.5 
 
 
232 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  37.64 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  42.71 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  42.71 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  42.71 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  40.8 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  42.71 
 
 
198 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  42.71 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  48.29 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  42.71 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  42.71 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  42.71 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  42.71 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  41.92 
 
 
198 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  39.9 
 
 
206 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  42.86 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  38.5 
 
 
213 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  40.7 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  38.19 
 
 
211 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  42.72 
 
 
229 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  38.61 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  42.92 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  37.13 
 
 
204 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  37.77 
 
 
247 aa  115  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  41.71 
 
 
198 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  41.71 
 
 
198 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  38.31 
 
 
196 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  41.71 
 
 
198 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  41.71 
 
 
198 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  38.69 
 
 
203 aa  115  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  41.71 
 
 
198 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  38.19 
 
 
212 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  39.39 
 
 
191 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  41.41 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  41.12 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  42.93 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  43.72 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  42.93 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  39.39 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  38.57 
 
 
201 aa  113  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  34.74 
 
 
184 aa  113  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  38.83 
 
 
230 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  41.83 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  39.9 
 
 
198 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  40 
 
 
198 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  40.1 
 
 
198 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  39.2 
 
 
256 aa  111  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  41.71 
 
 
198 aa  111  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  37.19 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  38.19 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  39.74 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  41.58 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  43.75 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  34.67 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  35.1 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  37.13 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  37.13 
 
 
191 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  38.19 
 
 
214 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0699  Ribonuclease H  39.9 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000499736  hitchhiker  0.00000400312 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  37 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  37.5 
 
 
198 aa  109  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  34.52 
 
 
257 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  39.9 
 
 
198 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  41.58 
 
 
215 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  39.34 
 
 
253 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  36.82 
 
 
191 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  40.1 
 
 
202 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  40.91 
 
 
201 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  38.97 
 
 
205 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  31.13 
 
 
197 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  38.97 
 
 
205 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  36 
 
 
211 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  40.91 
 
 
235 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  40.7 
 
 
209 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  39.59 
 
 
209 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  38.69 
 
 
212 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  33.33 
 
 
257 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  34.65 
 
 
209 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  33.33 
 
 
255 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  40.7 
 
 
209 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  38.69 
 
 
198 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2801  ribonuclease HII  41.21 
 
 
209 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  33.33 
 
 
255 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  38.69 
 
 
212 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1362  ribonuclease HII  40.2 
 
 
209 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  36.73 
 
 
203 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  39 
 
 
221 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  41.41 
 
 
240 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  40.4 
 
 
215 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>