More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2534 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  100 
 
 		 273 aa  528  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  58.15 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  62.91 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  54.74 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  57.42 
 
 		 246 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  53.77 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  58.3 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  50.9 
 
 		 221 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  57.85 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  55.71 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  49.51 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  45.09 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  45.16 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  51.71 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  41.9 
 
 		 201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  43.78 
 
 		 232 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  38.61 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 212 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  38.31 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  42.29 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  37.8 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  40 
 
 		 226 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  39.81 
 
 		 202 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  34.65 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  43.14 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  36.36 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  42.51 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  37.02 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  37.34 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  36.89 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  37.62 
 
 		 218 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  34.62 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  34.83 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  32.6 
 
 		 209 aa  112  9e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  38.61 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  37.34 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  38.81 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  36.06 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  39.11 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  35.44 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  37 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  43 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  37.61 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  38.42 
 
 		 194 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1405  Ribonuclease H  37.56 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000142088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  37.81 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  36.8 
 
 		 249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  30.91 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  38.61 
 
 		 199 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 201 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  40.8 
 
 		 201 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  32.34 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  38.5 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  38.54 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  34.58 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  32.39 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  39.3 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  37.13 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  36.62 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  35.29 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  36.23 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  41.79 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  39 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  40.69 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  38.12 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 214 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  35.81 
 
 		 203 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  38.12 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  39.71 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  38.65 
 
 		 208 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  38.61 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  38.73 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  37.13 
 
 		 193 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  39.8 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  38.61 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  39.22 
 
 		 209 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  39.22 
 
 		 209 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  39.22 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  38.83 
 
 		 217 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  38.73 
 
 		 240 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  38.83 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  37.8 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>