More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1476 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  100 
 
 		 279 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  61.16 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  59.64 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  50.97 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  58.62 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  58.94 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  53.81 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  50.22 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  51.49 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  55.9 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  49.35 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  44.93 
 
 		 231 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  40.41 
 
 		 247 aa  139  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  42.66 
 
 		 222 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  43.19 
 
 		 232 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 250 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  41.63 
 
 		 210 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  37.89 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  39.61 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  42.27 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  38.43 
 
 		 227 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  40.54 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  40.64 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  32.72 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  30.14 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10380  ribonuclease HII  38.28 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000218298  unclonable  0.00000000118399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  33.92 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  36.06 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  36.89 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  38.1 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  37.27 
 
 		 212 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  40.89 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  37.27 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  31.94 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1839  ribonuclease HII  42.23 
 
 		 196 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  38.84 
 
 		 224 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  36.64 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  29.46 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  36.44 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  32.86 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  36.99 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  33.94 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  33.76 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  38.12 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  37.39 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  33.64 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  32.88 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  32.88 
 
 		 221 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  35.12 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1045  Ribonuclease H  30.21 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  31.49 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  29.95 
 
 		 197 aa  105  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  35.27 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1405  Ribonuclease H  38.14 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000142088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  32.44 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  38.24 
 
 		 202 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  31.88 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  29.63 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  33.49 
 
 		 194 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  39.91 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  33.88 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  33.88 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  32.3 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  35.96 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  40.37 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  31.8 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  40.37 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  36.1 
 
 		 197 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  33.66 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  38.24 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  31.65 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  37.56 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  40.18 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  33.33 
 
 		 221 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  42.4 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  36.99 
 
 		 206 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  32.2 
 
 		 209 aa  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  36.11 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  36.14 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  36.53 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  30.7 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  39.42 
 
 		 215 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  29.27 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  31.73 
 
 		 198 aa  99  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  36.36 
 
 		 338 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  31.36 
 
 		 212 aa  99  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  35.92 
 
 		 202 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  37.33 
 
 		 209 aa  99  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  39.44 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  29.27 
 
 		 272 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  31.86 
 
 		 211 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  36.32 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  30.26 
 
 		 216 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  35.81 
 
 		 215 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  36.54 
 
 		 191 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  38.32 
 
 		 228 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  41.2 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  32.59 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>