More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1547 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  47.18 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  45.83 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 218 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 232 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  50 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  43.14 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  48.04 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 226 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  44.56 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  46.23 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 260 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  45.08 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  44.04 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 249 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  46.04 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 240 aa  147  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  43.65 
 
 		 193 aa  147  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  44.04 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  44.88 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  43.3 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  43.3 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  43 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 250 aa  145  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  44.16 
 
 		 254 aa  145  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  42.19 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  41.92 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  42.42 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  42.42 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  42.42 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  41.41 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  41.41 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  41.41 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  43.52 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  41.41 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  41.41 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  43.08 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 217 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  44.74 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  43.63 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  44.5 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  42.49 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  42.64 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.52 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  42.49 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  45.03 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  43.56 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  42.49 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6711  predicted protein  43.52 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00445618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  45.1 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>