More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1173 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  100 
 
 		 272 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  61.06 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  61.44 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  54.24 
 
 		 303 aa  222  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  55 
 
 		 221 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  56.62 
 
 		 246 aa  205  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  58.3 
 
 		 273 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  50.4 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  60.09 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  47.58 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  43.93 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 210 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  49.27 
 
 		 250 aa  142  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  41.52 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  41.15 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  42.27 
 
 		 222 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  37.46 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  43.89 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10380  ribonuclease HII  37.89 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000218298  unclonable  0.00000000118399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 212 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  40.17 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  33.62 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  35.78 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  35.27 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  41.9 
 
 		 201 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  36.56 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  36.56 
 
 		 232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  35.96 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  41.39 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  35.91 
 
 		 206 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  37.31 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  37.84 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  40 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  36.24 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1405  Ribonuclease H  39.44 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000142088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  33.66 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 209 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  31.63 
 
 		 206 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 209 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  38.73 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  37.02 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  34.78 
 
 		 207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  36.54 
 
 		 218 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  32.48 
 
 		 209 aa  119  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  34.12 
 
 		 204 aa  118  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  37.67 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  38.05 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  31.13 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  36.49 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  38.36 
 
 		 214 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  35.82 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  40.58 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  33.18 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  34.65 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  40.3 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  32.42 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  36.63 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  38.31 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  36.63 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  37.33 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  32.71 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  34.86 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  36.45 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  35.1 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  35.29 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  31.02 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  34.89 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  35.35 
 
 		 208 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  36.27 
 
 		 195 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  35.89 
 
 		 197 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  37.13 
 
 		 209 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  38.22 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  33.49 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  36.79 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  35.41 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  32.39 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  40 
 
 		 201 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  36.27 
 
 		 195 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  32.51 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  39.51 
 
 		 201 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  35.71 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  33.02 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  35.41 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  35.41 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  36.14 
 
 		 199 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  42.15 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  35.96 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  39.34 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  37.13 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  35.41 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  36.71 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  37.28 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  34.93 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  33.18 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>