More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2878 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  49.01 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 283 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  48.51 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  52.53 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  49.24 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 338 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  47.64 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  46.5 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.92 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  44.65 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  46.07 
 
 		 209 aa  174  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.4 
 
 		 277 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.11 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  42.64 
 
 		 242 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  44.61 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  46.37 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  46.37 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  47.12 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  46.5 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  50.73 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.69 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.15 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  44.29 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50 
 
 		 208 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 202 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 202 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 248 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.63 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  47.57 
 
 		 227 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  48.37 
 
 		 221 aa  155  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  48.6 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  50 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 210 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.17 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 199 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  43.35 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  50.84 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 198 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 198 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 218 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 198 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  49.15 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  47.92 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  47.92 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  44.44 
 
 		 193 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>